Das Aquarium und Terrarium befindet sich im unteren Teil der Wilhelma, nicht weit weg vom Haupteingang. Es ist im Inneren aufgeteilt in verschiedene Regionen. Nach dem Betreten kann man viele Unterwasserbewohner der gemäßigten Zonen beobachten. Im ersten Raum ist die Nordsee vertreten. Dann folgen Süßwasserbewohner und das Mittelmeer. In der Mitte des Gebäudes kommt das Terrarium mit der Krokodilhalle und vielen Reptilien. Den Abschluss bilden dann wieder überwiegend bunte Wasserbewohner aus dem tropischen Süßwasser und den Korallenriffen der Welt.

Untenstehend finden sie eine Übersichtskarte des Aquariums.